St. 博纳旺蒂尔大学

艺术学院 & 科学教师


张,小宁

小宁张

学术部门
生物学
学校的学术
文理学院

标题/责任
生物学教授,
委员会主席 生物化学项目
成员, 妊娠研究SBU联盟
和产前发育
联系
办公室
沃尔什科学中心216
课程
  • 生物105. 生物科学I 
  • 生物106. 生物科学II 
  • 生物技术概论
  • 生物技术导论
  • 生物371. 生物化学 
  • 杂志371年. 生物化学实验室  
  • 生物399. 生物学研讨会 
  • 生物406. 植物发育与生理  
  • 杂志406年. 植物发育与生理实验室  
  • 生物化学讲座
  • 生物466. 分子细胞生物学
  • 杂志466年. 分子细胞生物学实验室
  • 单位101. 学习者社区
学位
  • Ph.D.复旦大学,中国
  • M.S. & B.S.中国,南京大学
其他教育
  • M.A. 大索菲亚学院应用治疗艺术硕士
  • 博士后研究助理, 细胞生物学和分子遗传学学系, 马里兰大学, 学院公园, 2006-2009.
  • 2002-2006年,美国宾夕法尼亚大学生物系博士后研究员.
专业背景
成就

资助及奖励

  • 国家科学基金会
    • 选择性剪接在植物先天免疫调节中的作用. (2019-2023)
    • 协作:ABI开发:模式创建的方法论, 印验证, 和来自注释生物网的发现. (2012-2017)
    • RUI:克隆和表征 未成熟的花. (2010-2015)
  • 圣博纳文蒂尔大学
      基南奖:调整生物学实验室规划, 教学设计和共同核心大学准备写作标准促进学生学习. (2012-2013). 共同获奖者:Paula Kenneson,教育学院.
    • 社区学习奖学金(2009-2010). 共同获奖者:教育学院的Miguel Narvaez和Willy Rotich.

经同行评审的出版物(精选出版物). *为通讯作者)

  1. Samuel L. 陈s, Timothy J. 鲁尼T,安娜R. 胡,亨特S. 韦斯利·比尔德. 加勒特,莉安·M. 约旦·J·曼加拉特. 鲍尔斯,布莱特·库珀, 小宁张*. 定量蛋白质组学揭示了SERINE/ARGININE-RICH 45在调节RNA代谢和通过ASAP复合物调节转录抑制中的作用 拟南芥. 植物科学前沿. 2019年8月. DOI: 10.3389 /国家贫困线以下.2019.01116.
  2. 张楠楠,张丹丹,李国强. 陈,龚本强,郭彦军,徐拉红, Xiano-Ning张 李建峰*. 用于多基因沉默和简化转基因筛选的工程人工microrna. 植物生理学. 2018年11月. 178(3): 989-1001. DOI: 10.1104/pp.18.00828.
  3. 小宁张*, Yifei史, 约旦的权力, Nikhil高达, Chong张, Heba易卜拉欣, 汉娜球, 塞缪尔·陈, 华陆, 斯蒂芬·山. 转录组分析表明,SR45是拟南芥中一个中性剪接调节因子和先天免疫抑制因子. BMC基因组学. 18:722. 2017年10月11日. DOI: 10.1186/s12864-017-4183-7.
  4. 凯文·西拉诺,扎卡里·马扎内克,马哈茂达·汗,莎拉·梅特卡夫, 小宁张*. 一个新的突变, hap1-2, 揭示了AtMago蛋白C末端结构域的功能及其在雄性配子体发育中的生物学作用 拟南芥. PlosOne. 11(2):e0148200. 2016年2月11日. DOI: 10.1371 /杂志.玉米饼.0148200.
  5. 小宁张*,莫塞西莉亚,M. 加勒特,我是布莱特·库珀. 磷酸苏氨酸218是SR45发挥功能所必需的.1 .在调节花瓣发育中 拟南芥. 植物信号 & 行为. 2014. 9:e29134. DOI: 10.4161 /公安局.29134.
  6. 小宁张 & 斯蒂芬*山. 的两个可选拼接的同工异构体 拟南芥 SR45蛋白在植物正常发育过程中具有独特的作用. 植物杂志. 2009, 150(3): 1-9. DOI: 10.1104/pp.109.138180.

会议简报(近期讲座)

  1. 小宁张. 在我们从幼儿园到12年级的生活中教授DNA. WNY STEAM大会. 纽约布法罗. 2018年8月6日. (选择)
  2. 小宁张 和杰奎琳·菲利普. 在大学里向非理工科学生教授生物技术和转基因生物. 干细胞研究所. 艾尔弗雷德州立学院,纽约州. 2018年7月29日至31日. (选择)
  3. Rene Hauser, Jacqueline Philp和 小宁张. 不失时间:综合课程. 干细胞研究所. 艾尔弗雷德州立学院,纽约州. 2018年7月29日至31日. (选择)
  4. 小宁张,张冲,约旦的权力,陆华. 剪接激活子SR45是植物免疫的全局抑制因子. 植物会议转录后基因调控. 得克萨斯州奥斯汀市. 2016年7月14日至15日. (选择
  5. 小宁张. 健康花粉的高质量rna. 第十七届植物生物学研讨会,2016年5月26日. (邀请)
  6. 小宁张. 磷酸化调控通过剪接激活剂诱导前mrna剪接, SR45, 在花卉发育过程中. 动植物基因组第二十三届会议. 圣地亚哥,加州. 2015年1月10日至14日. (邀请)
学生研究海报(精华)
  1. 小宁张艾米丽·M. 亨特·兰西恩. 韦斯利·比尔德. 乔丹·加勒特. 鲍尔斯,张冲,Arthur G. 亨特,布雷特·库珀 & 华陆. 转录组和蛋白质组的比较分析揭示了丝氨酸/精氨酸富45在拟南芥先天免疫应答中的作用. FASEB研究会议-植物发育机制. 纽约Olean. 2019年7月28日至8月2日.
  2. 塞缪尔·陈, 蒂莫西·鲁尼, Yifei史, 史蒂夫·山, 猎人的胡子, Wesley 加勒特,我是布莱特·库珀, 小宁张. 转录组和蛋白质组在拟南芥繁殖过程中对前mrna剪接干扰的响应. 戈登研究会议:植物分子生物学. Holderness NH. 2018年6月10-15日.
  3. 约旦的权力张冲,陆华,张小宁. 拼接调节器, 丝氨酸/ Arginine-rich 45, 在拟南芥的先天免疫抑制中发挥了新的作用. 2017植物生物学大会. 夏威夷火奴鲁鲁. 7月. 24-28, 2017. (鲍尔斯获得了ASPB旅行奖.)
  4. 约旦的权力, Nikhil高达, 小宁张. RNA-seq数据分析揭示了SR45在植物先天免疫中的新作用. 锈带RNA会议. 克利夫兰,哦. 2016年10月14日至15日. (鲍尔斯的精选演讲. 曾获优秀大学生口头报告奖.)
  5. Vanya Aggarwal, Rijo Maracheril, 小宁张. AtKIN11和AtKIN10突变及其对蛋白质结构和葡萄糖传感的影响. 植物生物学会议. 明尼阿波利斯、锰. 2015年7月25日至29日.
教学理念
  1. 为主动学习创造互动的教学环境.
  2. 帮助学生将课本知识与现实问题联系起来.
  3. 把真正的研究项目带到教室和实验室.
  4. 向学生介绍科学界,让他们探索.
目前的研究兴趣/项目

生物不断地将来自周围环境的信息/信号纳入其生存策略,以最大限度地提高繁殖成功率. 我的长期兴趣是了解植物如何整合环境信号, 包括生物和非生物的压力, 进入生长发育的调控. 迈向这种理解的第一步是回答这个问题:植物如何通过调节前mrna剪接来响应环境信号来调节生长和发育?

前mrna剪接是所有真核细胞的必要调控步骤. 使用下一代测序(NGS), 科学家们已经发现了越来越多的剪接事件,即使是在研究得很好的物种中,以前也没有记录过. 到目前为止, 我的实验室发现了一个剪接激活剂, SR45, 参与植物生长发育,并对冷/热胁迫和糖供应作出反应(植物杂志. 150:1450-1458. 2009). 我们的工作表明,SR45蛋白上的单个磷酸化事件以组织特异性的方式直接影响SR45的功能(植物信号 & 行为. 9:e29134. 2014). 此外,我们还发现了SR45与7个蛋白之间的新关联,包括 U5 snRNP组分和SR蛋白采用共免疫沉淀(植物信号 & 行为. 9:e29134. 2014). 在与一位计算机科学家的合作中. Padmini Srinivasan, 来自爱荷华大学和马里兰大学的生物学家, 我们为生物学家开发并实地测试了一个文献扫描系统:FERRET (BMC BIOINFORMATICS). 16:198. 2015). 这篇论文在出版的第一个月就被全球网赌十大网站了4000多次.

我计划将上述工作扩展到以下三个目标:

  1. 确定SR45参与的分子网络.
  2. 了解物种间剪接网络的进化意义.
  3. 探讨RNA质量控制导致雄性配子体发育成功的机制.

随着NGS和蛋白质组学的快速发展, 我们试图回答sr45调控的剪接事件中有多少在蛋白质水平上具有生物学重要性的问题. 生物信息学分析, 我们最近发现SR45可能通过控制一部分防御基因来抑制植物先天免疫. 这就打开了一个令人兴奋的局面, pre-RNA剪接机制调控植物免疫的研究尚待探索. 这将有助于阐明SR45在剪接中的新作用, 基因沉默, 非生物应激反应和其他尚未揭示.

An DNASTAR采访是一家全球性的生物信息学软件公司,它抓住了我的研究兴趣和目前的活动.

对分子生物学培训机会感兴趣的本科生, 遗传学, 生物化学和/或生物信息学欢迎联系我潜在的研究经验.

个人兴趣/社区参与
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